Nối tiếp phần 2, Saito và Louise trở về Tristain, nhưng dấu hiệu kết nối Saito và Louise bị biến mất. Cả 2 tranh cãi lẫn nhau khi mối quan hệ Chủ nhân và linh thú không còn nữa, đồng thời cả 2 đi tìm yêu tinh có sức mạnh đã hồi sinh Saito, và có thể là chìa khóa để giải thích sao Saito lại bị mất quyền năng Gandalfr
Shiki là một chàng trai loài người sống cùng với rất nhiều người máy ở một hành tinh phỏng theo công viên giải trí tên là Grandbell, thuộc vũ trụ có tên là Sakura Cosmos. Một ngày nọ có hai vị du khách tới ghé thăm hành tinh này là một cô gái tên Rebecca cùng một chú mèo biết nói tên Happy.
Câu chuyện kể về cuốn nhật kí chứa đầy kinh nghiệm của Kiitarou với yêu quái.Anh ấy là một cậu bé với một ý nghĩa tinh thần rất mạnh mẽ và khi anh tới nhà kho bị cấm. Anh đã sớm tìm thấy một nơi để sinh sống ở đó và gặp được một hồn ma tên là Suzu. Anh và Suzu nhanh chóng hợp lực chống lại các loại quái vật, khởi đầu với một Nurikabe (một loại ma ngăn cản du khách) và mokumokuran
Mối quan hệ giữa cả hai dần thay đổi thông qua công việc thường ngày và các sự kiện của công ty, họ bắt đầu dành thời gian cho nhau trong cuộc sống riêng tư nhưng cả hai đều vụng về trong chuyện tình cảm và không thể thu hẹp khoảng cách.
Câu chuyện tiếp tục nơi mùa đầu tiên rời đi, sau cuộc hành trình tự khám phá Takemoto của vòng quanh Nhật Bản. Tất nhiên, các hình tam giác tình yêu và đau khổ họ phải đối mặt sẽ tiếp tục, và cuối cùng quyết định các đường dẫn đến tương lai của họ